STR的历史背景
系错误问题已有50年历史,基于国际库的分析数据显示:1984年错误率为35%,19年为18%,直到近几年,应用于生物领域的系需要的问题仍然很少有人关注。
2011年初,美国菌种保藏中心(ATCC)**了人源系STR标准,旨在约束因交叉污染和错误辨识所导致的无效科研数据的不断扩增现象。大量研究表明 STR 分型方法是进行交叉污染和性质的有效和准确的方法之一,STR分型应用于细胞鉴定已被ATCC等机构强烈**。美国的ATCC 库、德国的*Z库以及日本的JCRB库等为STR 分型提供了各株的数据供比对依据。
北京科鉴基因中心,专注细胞STR鉴定十三年
科鉴基因细胞STR鉴定服务项目:
1、人源细胞STR分型检测;
2、人源细胞来源一致性检测;
3、人/鼠细胞交叉污染检测;
4、中小鼠源饲养层细胞污染检测;
5、*鼠源饲养层细胞污染检测;
6、异体细胞移植后嵌合情况检查。
2011年美国地区标准学会颁布了一份细胞STR鉴定地区标准;2014 年12 月、2015 年2 月Science 杂志分别发表文章专题阐述细胞交叉污染和错误辨识严重性;2015 年4 月Nature通知:Nature 旗下杂志将从5 月开始要求作者鉴定论文中所用细胞系;2015年6月有报道称一科学家由于用错细胞系,撤销Nature论文。其实关于细胞污染问题不少机构、学者一直呼吁各个实验室及相关机构重视。
据统计约30%细胞系被交叉污染或错误辨识[1-7],因使用了交叉污染或错误辨识的细胞而导致研究结论错误、结果不可重复、细胞灾难性后果……,这浪费大量时间、精力和**。因此近年NIH、ATCC、Nature和Science等对此多次发出呼吁,要求研究者对细胞进行鉴定[4,5,7-11],如2011年美国地区标准学会颁布了一份细胞STR鉴定地区标准[12];2014年12月、2015年2月Science杂志分别发表文章专题阐述细胞交叉污染和错误辨识严重性[4,5];2015年4月Nature通知:Nature旗下杂志将从5月开始要求作者鉴定论文中所用细胞系[10];2015年6月有报道称一科学家由于用错细胞系,撤销Nature论文。STR(Short Tandem Repeat,短串联重复序列)基因分型已被ICLAC、ATCC等机构作为金标准应用于细胞鉴定[11-13],目前越来越多的杂志要求在投稿时提供细胞STR分型数据。
STR基因位点由长度为3~7个碱基对的短串连重复序列组成[14],这些重复序列广泛存在于人类基因组中,可作为高度多态性标记,被称为细胞的DNA指纹(如目前我们亲子鉴定即采用该技术),其可通过PCR(聚合酶链式反应)来检测。STR基因座位上的等位基因可通过扩增区域内重复序列的拷贝数的不同来区分,在毛细管电泳分离之后可通过荧光检测来识别,随后通过一定的计算方法[13,15],即可根据所得的STR分型结果与的细胞STR数据库比对从而推算出样品所属的细胞系或可能的交叉污染的细胞系名称。
细胞STR鉴定,科鉴基因更:
化团队:积累了近10年的亲子鉴定的资质和资历,拥有生物学研发队伍,**细胞STR数据;
的数据库对比:拥有自主建立的、*的STR数据库(有近8000条人细胞系STR数据,囊括ATCC、*Z、JCRB和RIKEN细胞库人源细胞的STR数据,约含2000条系STR数据),实现人细胞来源鉴定及可能污染的细胞的辨识;
多基因检测、高灵敏度:可同时检测16、21或40个STR位点,仅需3ng DNA即可判断细胞类型及可能的细胞交叉污染;
常用的21个STR位点名称:
D5S818D13S317D7S820D16S539VWATH01TPOXAmelogenin (性别位点)CSF1POD3S1358Penta ED2S441D2S1338Penta DD10S1248D19S433D21S11D18S51D6S1043D8S1179D12S391FGA
若我需要鉴定的细胞没有文献报道有STR数据,请问还能做STR鉴定吗?
答:尽管我司建立的STR数据库有目前全的人源细胞系STR数据,但有些文献未报道STR数据的细胞系(国内自行建立的细胞系)在我们数据库中可能也没有其STR数据。不过,我们仍建议您进行细胞STR鉴定,因为通过该项检测,您可以:1、判断您培养的该细胞是否被其他细胞交叉污染及其可能被污染的细胞名称;2、您将是个得到该细胞系STR数据(DNA指纹)的人。
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兹证明北京华彦科技有限公司**鉴定所与华科鉴联基因科技(北京)有限公司达成合作。授权华科鉴联基因科技(北京)有限公司,负责北京、河北及周边地市的DNA亲子鉴定、亲权鉴定、个体识别等相关业务的宣传、推广、取样活动。华科鉴联基因科技(北京)有限公司所发信息中的鉴定由北京华彦科技有限公司**鉴定所检测、报告由北京华彦科技有限公司**鉴定所出具。
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